Έγραφα συγκεκριμένα: «Και να θυμίσουμε ότι χάρη σε έναν σημαντικό σύμμαχο των ανθρωπίνων δικαιωμάτων στην Ελλάδα, τον Γενικό Γραμματέα Ανθρωπίνων Δικαιωμάτων Κωστή Παπαϊωάννου είχαμε πριν λίγο καιρό μια επίσημη παρέμβαση κρατικού φορέα. κος Παπαϊωάννου, απ' τον οποίο πήρα τις προηγούμενες ημέρες συνέντευξη και θα δημοσιευθεί σύντομα, είχε στείλει στον εισαγγελέα τις δηλώσεις του Μητροπολίτη Χίου για τους πρόσφυγες. Σήμερα τον ρώτησα αν ξέρει τι απέγινε με την υπόθεση. Αγνόησαν και τον Γενικό Γραμματέα του Υπουργείου Δικαιοσύνης; Θα το ψάξει και θα με ενημερώσει. Πάντως, με την πράξη του κου Παπαϊωάννου, είναι και επίσημο πως έστω κάποιος απ' την κυβέρνηση έχει αντιδράσει.» 8.11.2016
Ούτε μία εβδομάδα δεν είχε περάσει από τότε, όταν έμαθα τη δυσάρεστη είδηση της παραίτησής του, με το που αντικαταστάθηκε στον ανασχηματισμό ο Νίκος Παρασκευόπουλος (μέχρι τότε υπουργός Δικαιοσύνης, Διαφάνειας και Ανθρωπίνων Δικαιωμάτων) απ' τον Σταύρο Κοντονή. Στην σχετική του ανακοίνωση κατέληγε: «Κλείνω αυτόν τον κύκλο με τη βεβαιότητα πως στη σημερινή συγκυρία κάθε θεσμική υποχώρηση κοστίζει πολύ ακριβά, είτε αφορά στις σχέσεις κράτους και Εκκλησίας είτε στα θεμελιώδη δικαιώματα των προσφύγων. Όμως η προσπάθεια για τη διασφάλιση των ανθρωπίνων δικαιωμάτων είναι διαρκής. Στην προσπάθεια αυτή θα είμαι παρών».
Πατώντας εδώ θα σας εμφανιστεί ολόκληρο το άρθρο όπως δημοσιεύτηκε στη lifo στις 19.11.16.

Λίγο μετά την παραίτησή του από Γενικός Γραμματέας Ανθρωπίνων Δικαιωμάτων, εξηγεί στο LIFO.gr γιατί φεύγει και μιλά για το έργο του, την Εκκλησία, τη Χρυσή Αυγή, το Σύμφωνο Συμβίωσης, το προσφυγικό κ.α. Του Άρη Δημοκίδη.